Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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CALCOCO2Q13137 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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CALCOCO2Q13137 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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