Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms