Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms