Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRJQ12913 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
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PTPRJQ12913 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
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PTPRJQ12913 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
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PTPRJQ12913 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
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PTPRJQ12913 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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