Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX4Q12846 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX4Q12846 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX4Q12846 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX4Q12846 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX4Q12846 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX4Q12846 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX4Q12846 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX4Q12846 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX4Q12846 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX4Q12846 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX4Q12846 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX4Q12846 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX4Q12846 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX4Q12846 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
STX4Q12846 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX4Q12846 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX4Q12846 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX4Q12846 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX4Q12846 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX4Q12846 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX4Q12846 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX4Q12846 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX4Q12846 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
STX4Q12846 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX4Q12846 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
STX4Q12846 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX4Q12846 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX4Q12846 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX4Q12846 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX4Q12846 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
STX4Q12846 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX4Q12846 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX4Q12846 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX4Q12846 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX4Q12846 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX4Q12846 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX4Q12846 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX4Q12846 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX4Q12846 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX4Q12846 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX4Q12846 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX4Q12846 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX4Q12846 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX4Q12846 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX4Q12846 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX4Q12846 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX4Q12846 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX4Q12846 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX4Q12846 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX4Q12846 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX4Q12846 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX4Q12846 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX4Q12846 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX4Q12846 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX4Q12846 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX4Q12846 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX4Q12846 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX4Q12846 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX4Q12846 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX4Q12846 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX4Q12846 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX4Q12846 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX4Q12846 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX4Q12846 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX4Q12846 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX4Q12846 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX4Q12846 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX4Q12846 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX4Q12846 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX4Q12846 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX4Q12846 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX4Q12846 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX4Q12846 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX4Q12846 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
STX4Q12846 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX4Q12846 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX4Q12846 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX4Q12846 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX4Q12846 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX4Q12846 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX4Q12846 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX4Q12846 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX4Q12846 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX4Q12846 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX4Q12846 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX4Q12846 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX4Q12846 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX4Q12846 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
STX4Q12846 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
STX4Q12846 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
STX4Q12846 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
STX4Q12846 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
STX4Q12846 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
STX4Q12846 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
STX4Q12846 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
STX4Q12846 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
STX4Q12846 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
STX4Q12846 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
STX4Q12846 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms