Protein–RNA interactions for Protein: Q12840

KIF5A, Kinesin heavy chain isoform 5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF5AQ12840 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KIF5AQ12840 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms