Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SREBF2Q12772 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SREBF2Q12772 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SREBF2Q12772 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SREBF2Q12772 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SREBF2Q12772 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SREBF2Q12772 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SREBF2Q12772 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SREBF2Q12772 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SREBF2Q12772 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SREBF2Q12772 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SREBF2Q12772 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SREBF2Q12772 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SREBF2Q12772 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SREBF2Q12772 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SREBF2Q12772 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SREBF2Q12772 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SREBF2Q12772 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SREBF2Q12772 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SREBF2Q12772 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SREBF2Q12772 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SREBF2Q12772 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SREBF2Q12772 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SREBF2Q12772 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SREBF2Q12772 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SREBF2Q12772 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SREBF2Q12772 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SREBF2Q12772 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SREBF2Q12772 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SREBF2Q12772 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SREBF2Q12772 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SREBF2Q12772 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SREBF2Q12772 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SREBF2Q12772 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SREBF2Q12772 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SREBF2Q12772 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SREBF2Q12772 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SREBF2Q12772 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SREBF2Q12772 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SREBF2Q12772 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SREBF2Q12772 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SREBF2Q12772 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SREBF2Q12772 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SREBF2Q12772 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SREBF2Q12772 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SREBF2Q12772 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SREBF2Q12772 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SREBF2Q12772 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SREBF2Q12772 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SREBF2Q12772 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SREBF2Q12772 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SREBF2Q12772 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SREBF2Q12772 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SREBF2Q12772 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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