Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms