Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms