Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXM1Q08050 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FOXM1Q08050 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FOXM1Q08050 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FOXM1Q08050 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXM1Q08050 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXM1Q08050 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXM1Q08050 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXM1Q08050 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXM1Q08050 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXM1Q08050 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXM1Q08050 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXM1Q08050 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXM1Q08050 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXM1Q08050 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXM1Q08050 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXM1Q08050 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXM1Q08050 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXM1Q08050 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms