Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOX4Q06945 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOX4Q06945 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOX4Q06945 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOX4Q06945 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOX4Q06945 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms