Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms