Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms