Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms