Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RELAQ04206 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RELAQ04206 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RELAQ04206 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RELAQ04206 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RELAQ04206 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RELAQ04206 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RELAQ04206 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RELAQ04206 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RELAQ04206 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RELAQ04206 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RELAQ04206 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RELAQ04206 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RELAQ04206 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RELAQ04206 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RELAQ04206 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RELAQ04206 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RELAQ04206 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RELAQ04206 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RELAQ04206 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RELAQ04206 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RELAQ04206 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RELAQ04206 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RELAQ04206 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RELAQ04206 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RELAQ04206 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RELAQ04206 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RELAQ04206 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RELAQ04206 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RELAQ04206 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RELAQ04206 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RELAQ04206 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RELAQ04206 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RELAQ04206 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RELAQ04206 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RELAQ04206 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RELAQ04206 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RELAQ04206 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RELAQ04206 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RELAQ04206 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RELAQ04206 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RELAQ04206 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RELAQ04206 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RELAQ04206 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RELAQ04206 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RELAQ04206 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RELAQ04206 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RELAQ04206 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RELAQ04206 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RELAQ04206 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RELAQ04206 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RELAQ04206 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RELAQ04206 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RELAQ04206 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RELAQ04206 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RELAQ04206 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RELAQ04206 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RELAQ04206 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RELAQ04206 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RELAQ04206 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RELAQ04206 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RELAQ04206 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RELAQ04206 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RELAQ04206 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RELAQ04206 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RELAQ04206 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RELAQ04206 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RELAQ04206 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RELAQ04206 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RELAQ04206 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RELAQ04206 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RELAQ04206 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RELAQ04206 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RELAQ04206 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RELAQ04206 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RELAQ04206 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RELAQ04206 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RELAQ04206 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RELAQ04206 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RELAQ04206 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RELAQ04206 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RELAQ04206 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RELAQ04206 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RELAQ04206 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RELAQ04206 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RELAQ04206 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RELAQ04206 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RELAQ04206 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RELAQ04206 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RELAQ04206 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RELAQ04206 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RELAQ04206 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RELAQ04206 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RELAQ04206 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RELAQ04206 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RELAQ04206 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RELAQ04206 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RELAQ04206 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RELAQ04206 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RELAQ04206 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms