Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAV1Q03135 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms