Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms