Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms