Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms