Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BEX3Q00994 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms