Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms