Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK3Q00526 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms