Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF3P78545 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF3P78545 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF3P78545 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF3P78545 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF3P78545 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF3P78545 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF3P78545 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF3P78545 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF3P78545 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF3P78545 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF3P78545 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF3P78545 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF3P78545 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF3P78545 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF3P78545 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF3P78545 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF3P78545 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF3P78545 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF3P78545 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELF3P78545 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELF3P78545 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELF3P78545 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELF3P78545 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELF3P78545 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELF3P78545 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELF3P78545 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELF3P78545 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELF3P78545 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELF3P78545 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELF3P78545 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELF3P78545 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELF3P78545 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELF3P78545 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ELF3P78545 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELF3P78545 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELF3P78545 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELF3P78545 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELF3P78545 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELF3P78545 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELF3P78545 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ELF3P78545 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELF3P78545 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELF3P78545 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ELF3P78545 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELF3P78545 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELF3P78545 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELF3P78545 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELF3P78545 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELF3P78545 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELF3P78545 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELF3P78545 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELF3P78545 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELF3P78545 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELF3P78545 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELF3P78545 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELF3P78545 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELF3P78545 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELF3P78545 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELF3P78545 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELF3P78545 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELF3P78545 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELF3P78545 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELF3P78545 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELF3P78545 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELF3P78545 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELF3P78545 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELF3P78545 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELF3P78545 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELF3P78545 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELF3P78545 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELF3P78545 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELF3P78545 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELF3P78545 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELF3P78545 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELF3P78545 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELF3P78545 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELF3P78545 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELF3P78545 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELF3P78545 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELF3P78545 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELF3P78545 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELF3P78545 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ELF3P78545 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELF3P78545 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ELF3P78545 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELF3P78545 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELF3P78545 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELF3P78545 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELF3P78545 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELF3P78545 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ELF3P78545 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ELF3P78545 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ELF3P78545 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ELF3P78545 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELF3P78545 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELF3P78545 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELF3P78545 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELF3P78545 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELF3P78545 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms