Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKP1P63208 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKP1P63208 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKP1P63208 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKP1P63208 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKP1P63208 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKP1P63208 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKP1P63208 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKP1P63208 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKP1P63208 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKP1P63208 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKP1P63208 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKP1P63208 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKP1P63208 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKP1P63208 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKP1P63208 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKP1P63208 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKP1P63208 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKP1P63208 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKP1P63208 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKP1P63208 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKP1P63208 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKP1P63208 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKP1P63208 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKP1P63208 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKP1P63208 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKP1P63208 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKP1P63208 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKP1P63208 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKP1P63208 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKP1P63208 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKP1P63208 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKP1P63208 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKP1P63208 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKP1P63208 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKP1P63208 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SKP1P63208 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKP1P63208 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKP1P63208 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKP1P63208 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKP1P63208 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SKP1P63208 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKP1P63208 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKP1P63208 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKP1P63208 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKP1P63208 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKP1P63208 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKP1P63208 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKP1P63208 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKP1P63208 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKP1P63208 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKP1P63208 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SKP1P63208 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SKP1P63208 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKP1P63208 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKP1P63208 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKP1P63208 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKP1P63208 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKP1P63208 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP1P63208 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP1P63208 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP1P63208 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP1P63208 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP1P63208 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP1P63208 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP1P63208 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP1P63208 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP1P63208 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP1P63208 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP1P63208 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP1P63208 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP1P63208 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP1P63208 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP1P63208 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP1P63208 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP1P63208 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP1P63208 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP1P63208 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP1P63208 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP1P63208 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP1P63208 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP1P63208 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP1P63208 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP1P63208 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP1P63208 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP1P63208 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP1P63208 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP1P63208 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP1P63208 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP1P63208 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP1P63208 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP1P63208 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP1P63208 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP1P63208 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP1P63208 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP1P63208 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP1P63208 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP1P63208 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP1P63208 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP1P63208 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms