Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms