Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB15P59190 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB15P59190 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB15P59190 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB15P59190 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB15P59190 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB15P59190 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB15P59190 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB15P59190 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB15P59190 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB15P59190 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB15P59190 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB15P59190 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB15P59190 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB15P59190 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB15P59190 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB15P59190 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB15P59190 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB15P59190 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB15P59190 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB15P59190 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB15P59190 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB15P59190 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB15P59190 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB15P59190 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB15P59190 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB15P59190 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB15P59190 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB15P59190 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB15P59190 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB15P59190 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB15P59190 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB15P59190 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB15P59190 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB15P59190 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB15P59190 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB15P59190 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB15P59190 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB15P59190 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB15P59190 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB15P59190 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB15P59190 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB15P59190 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB15P59190 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB15P59190 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB15P59190 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB15P59190 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB15P59190 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB15P59190 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB15P59190 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB15P59190 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB15P59190 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB15P59190 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB15P59190 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB15P59190 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB15P59190 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB15P59190 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB15P59190 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB15P59190 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB15P59190 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB15P59190 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB15P59190 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB15P59190 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB15P59190 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB15P59190 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB15P59190 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB15P59190 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB15P59190 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB15P59190 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB15P59190 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB15P59190 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB15P59190 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB15P59190 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB15P59190 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB15P59190 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB15P59190 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB15P59190 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB15P59190 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB15P59190 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB15P59190 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB15P59190 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB15P59190 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB15P59190 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB15P59190 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB15P59190 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB15P59190 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB15P59190 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB15P59190 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB15P59190 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB15P59190 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB15P59190 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB15P59190 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB15P59190 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB15P59190 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB15P59190 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB15P59190 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB15P59190 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB15P59190 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB15P59190 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB15P59190 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms