Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX16P57768 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX16P57768 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX16P57768 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX16P57768 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX16P57768 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX16P57768 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX16P57768 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX16P57768 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX16P57768 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX16P57768 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX16P57768 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX16P57768 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX16P57768 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX16P57768 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX16P57768 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX16P57768 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX16P57768 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX16P57768 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX16P57768 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX16P57768 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX16P57768 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX16P57768 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX16P57768 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX16P57768 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX16P57768 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX16P57768 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX16P57768 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX16P57768 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX16P57768 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX16P57768 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX16P57768 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX16P57768 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX16P57768 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX16P57768 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX16P57768 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX16P57768 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX16P57768 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX16P57768 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX16P57768 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX16P57768 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX16P57768 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX16P57768 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX16P57768 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX16P57768 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX16P57768 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX16P57768 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX16P57768 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX16P57768 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX16P57768 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX16P57768 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX16P57768 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX16P57768 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX16P57768 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX16P57768 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX16P57768 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX16P57768 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX16P57768 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX16P57768 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX16P57768 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX16P57768 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX16P57768 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX16P57768 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX16P57768 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX16P57768 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX16P57768 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX16P57768 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX16P57768 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX16P57768 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX16P57768 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX16P57768 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX16P57768 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX16P57768 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX16P57768 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX16P57768 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX16P57768 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX16P57768 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX16P57768 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX16P57768 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX16P57768 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX16P57768 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX16P57768 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX16P57768 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX16P57768 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX16P57768 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX16P57768 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX16P57768 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX16P57768 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX16P57768 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX16P57768 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX16P57768 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX16P57768 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX16P57768 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX16P57768 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX16P57768 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX16P57768 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX16P57768 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX16P57768 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX16P57768 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX16P57768 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms