Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BACE1P56817 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BACE1P56817 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BACE1P56817 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BACE1P56817 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BACE1P56817 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BACE1P56817 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BACE1P56817 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BACE1P56817 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BACE1P56817 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BACE1P56817 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BACE1P56817 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BACE1P56817 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BACE1P56817 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BACE1P56817 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BACE1P56817 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BACE1P56817 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BACE1P56817 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BACE1P56817 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BACE1P56817 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BACE1P56817 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BACE1P56817 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BACE1P56817 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BACE1P56817 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BACE1P56817 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BACE1P56817 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BACE1P56817 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BACE1P56817 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BACE1P56817 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BACE1P56817 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BACE1P56817 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BACE1P56817 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BACE1P56817 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BACE1P56817 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BACE1P56817 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BACE1P56817 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
BACE1P56817 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BACE1P56817 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BACE1P56817 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BACE1P56817 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BACE1P56817 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BACE1P56817 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BACE1P56817 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BACE1P56817 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BACE1P56817 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BACE1P56817 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BACE1P56817 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BACE1P56817 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BACE1P56817 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BACE1P56817 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BACE1P56817 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BACE1P56817 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BACE1P56817 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BACE1P56817 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BACE1P56817 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BACE1P56817 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BACE1P56817 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BACE1P56817 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BACE1P56817 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BACE1P56817 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BACE1P56817 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BACE1P56817 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BACE1P56817 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BACE1P56817 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BACE1P56817 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BACE1P56817 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BACE1P56817 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BACE1P56817 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BACE1P56817 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BACE1P56817 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BACE1P56817 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BACE1P56817 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BACE1P56817 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BACE1P56817 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BACE1P56817 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BACE1P56817 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BACE1P56817 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BACE1P56817 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BACE1P56817 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BACE1P56817 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BACE1P56817 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BACE1P56817 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BACE1P56817 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BACE1P56817 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BACE1P56817 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BACE1P56817 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BACE1P56817 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BACE1P56817 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BACE1P56817 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BACE1P56817 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BACE1P56817 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BACE1P56817 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BACE1P56817 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BACE1P56817 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BACE1P56817 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BACE1P56817 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BACE1P56817 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BACE1P56817 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BACE1P56817 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BACE1P56817 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms