Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPTEP56180 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPTEP56180 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPTEP56180 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPTEP56180 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPTEP56180 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPTEP56180 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPTEP56180 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPTEP56180 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPTEP56180 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPTEP56180 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPTEP56180 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPTEP56180 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPTEP56180 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPTEP56180 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPTEP56180 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPTEP56180 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPTEP56180 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPTEP56180 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPTEP56180 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPTEP56180 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TPTEP56180 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPTEP56180 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPTEP56180 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPTEP56180 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPTEP56180 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPTEP56180 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPTEP56180 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPTEP56180 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPTEP56180 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPTEP56180 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPTEP56180 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TPTEP56180 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPTEP56180 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPTEP56180 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TPTEP56180 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPTEP56180 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPTEP56180 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPTEP56180 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPTEP56180 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPTEP56180 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPTEP56180 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPTEP56180 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPTEP56180 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPTEP56180 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPTEP56180 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPTEP56180 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPTEP56180 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPTEP56180 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPTEP56180 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPTEP56180 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPTEP56180 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPTEP56180 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPTEP56180 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TPTEP56180 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TPTEP56180 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TPTEP56180 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TPTEP56180 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TPTEP56180 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TPTEP56180 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TPTEP56180 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TPTEP56180 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TPTEP56180 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TPTEP56180 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TPTEP56180 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TPTEP56180 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TPTEP56180 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TPTEP56180 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TPTEP56180 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TPTEP56180 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TPTEP56180 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TPTEP56180 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TPTEP56180 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TPTEP56180 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TPTEP56180 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TPTEP56180 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TPTEP56180 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TPTEP56180 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TPTEP56180 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TPTEP56180 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TPTEP56180 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TPTEP56180 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TPTEP56180 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TPTEP56180 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TPTEP56180 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TPTEP56180 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TPTEP56180 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TPTEP56180 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TPTEP56180 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TPTEP56180 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TPTEP56180 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TPTEP56180 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TPTEP56180 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TPTEP56180 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TPTEP56180 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TPTEP56180 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TPTEP56180 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TPTEP56180 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TPTEP56180 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TPTEP56180 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms