Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HK3P52790 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HK3P52790 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HK3P52790 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HK3P52790 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HK3P52790 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HK3P52790 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HK3P52790 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HK3P52790 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HK3P52790 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HK3P52790 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HK3P52790 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HK3P52790 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HK3P52790 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HK3P52790 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HK3P52790 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HK3P52790 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HK3P52790 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HK3P52790 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HK3P52790 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HK3P52790 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HK3P52790 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HK3P52790 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HK3P52790 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HK3P52790 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HK3P52790 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HK3P52790 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HK3P52790 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HK3P52790 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HK3P52790 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HK3P52790 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HK3P52790 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HK3P52790 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HK3P52790 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HK3P52790 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HK3P52790 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HK3P52790 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HK3P52790 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HK3P52790 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HK3P52790 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HK3P52790 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HK3P52790 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HK3P52790 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HK3P52790 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HK3P52790 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HK3P52790 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HK3P52790 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HK3P52790 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HK3P52790 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HK3P52790 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HK3P52790 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HK3P52790 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HK3P52790 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HK3P52790 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HK3P52790 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HK3P52790 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HK3P52790 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HK3P52790 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HK3P52790 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HK3P52790 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HK3P52790 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HK3P52790 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HK3P52790 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HK3P52790 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HK3P52790 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HK3P52790 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HK3P52790 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HK3P52790 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HK3P52790 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HK3P52790 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HK3P52790 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HK3P52790 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HK3P52790 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HK3P52790 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HK3P52790 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HK3P52790 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HK3P52790 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HK3P52790 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HK3P52790 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HK3P52790 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HK3P52790 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HK3P52790 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HK3P52790 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HK3P52790 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HK3P52790 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HK3P52790 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HK3P52790 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HK3P52790 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HK3P52790 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HK3P52790 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HK3P52790 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HK3P52790 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HK3P52790 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HK3P52790 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HK3P52790 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HK3P52790 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HK3P52790 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HK3P52790 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HK3P52790 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HK3P52790 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms