Protein–RNA interactions for Protein: P49005

POLD2, DNA polymerase delta subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD2P49005 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD2P49005 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD2P49005 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD2P49005 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD2P49005 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD2P49005 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD2P49005 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD2P49005 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD2P49005 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD2P49005 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD2P49005 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD2P49005 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD2P49005 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD2P49005 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD2P49005 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD2P49005 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD2P49005 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD2P49005 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD2P49005 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD2P49005 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD2P49005 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD2P49005 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD2P49005 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD2P49005 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD2P49005 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD2P49005 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD2P49005 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD2P49005 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD2P49005 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD2P49005 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD2P49005 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD2P49005 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD2P49005 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD2P49005 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD2P49005 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD2P49005 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD2P49005 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD2P49005 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD2P49005 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD2P49005 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD2P49005 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD2P49005 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD2P49005 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD2P49005 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD2P49005 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD2P49005 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD2P49005 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD2P49005 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD2P49005 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD2P49005 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD2P49005 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD2P49005 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD2P49005 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLD2P49005 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLD2P49005 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLD2P49005 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
POLD2P49005 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLD2P49005 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLD2P49005 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLD2P49005 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD2P49005 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD2P49005 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD2P49005 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD2P49005 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD2P49005 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD2P49005 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD2P49005 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD2P49005 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD2P49005 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD2P49005 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD2P49005 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD2P49005 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD2P49005 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD2P49005 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD2P49005 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD2P49005 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD2P49005 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD2P49005 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD2P49005 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD2P49005 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD2P49005 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD2P49005 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD2P49005 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD2P49005 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD2P49005 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD2P49005 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD2P49005 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD2P49005 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD2P49005 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD2P49005 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD2P49005 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD2P49005 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD2P49005 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD2P49005 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD2P49005 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD2P49005 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD2P49005 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD2P49005 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD2P49005 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD2P49005 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms