Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPZBP47756 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms