Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AFMP43652 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AFMP43652 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
AFMP43652 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
AFMP43652 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AFMP43652 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AFMP43652 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AFMP43652 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AFMP43652 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AFMP43652 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
AFMP43652 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AFMP43652 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AFMP43652 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AFMP43652 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AFMP43652 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AFMP43652 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AFMP43652 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AFMP43652 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AFMP43652 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AFMP43652 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AFMP43652 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AFMP43652 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AFMP43652 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AFMP43652 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AFMP43652 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AFMP43652 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AFMP43652 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AFMP43652 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AFMP43652 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AFMP43652 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AFMP43652 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AFMP43652 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
AFMP43652 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AFMP43652 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
AFMP43652 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AFMP43652 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AFMP43652 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AFMP43652 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AFMP43652 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AFMP43652 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AFMP43652 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AFMP43652 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AFMP43652 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AFMP43652 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AFMP43652 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AFMP43652 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AFMP43652 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AFMP43652 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
AFMP43652 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AFMP43652 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AFMP43652 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AFMP43652 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AFMP43652 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AFMP43652 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AFMP43652 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AFMP43652 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AFMP43652 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AFMP43652 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AFMP43652 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
AFMP43652 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AFMP43652 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AFMP43652 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AFMP43652 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
AFMP43652 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AFMP43652 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
AFMP43652 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AFMP43652 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
AFMP43652 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AFMP43652 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AFMP43652 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AFMP43652 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AFMP43652 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AFMP43652 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AFMP43652 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AFMP43652 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AFMP43652 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AFMP43652 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
AFMP43652 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFMP43652 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFMP43652 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFMP43652 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFMP43652 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFMP43652 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFMP43652 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFMP43652 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFMP43652 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFMP43652 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFMP43652 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFMP43652 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFMP43652 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFMP43652 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFMP43652 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFMP43652 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFMP43652 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFMP43652 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFMP43652 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFMP43652 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFMP43652 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
AFMP43652 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AFMP43652 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms