Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGIRP43119 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGIRP43119 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGIRP43119 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGIRP43119 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGIRP43119 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGIRP43119 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGIRP43119 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGIRP43119 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGIRP43119 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGIRP43119 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGIRP43119 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGIRP43119 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGIRP43119 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTGIRP43119 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms