Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETFBP38117 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETFBP38117 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETFBP38117 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETFBP38117 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ETFBP38117 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETFBP38117 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETFBP38117 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETFBP38117 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETFBP38117 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETFBP38117 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETFBP38117 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETFBP38117 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETFBP38117 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETFBP38117 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFBP38117 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFBP38117 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFBP38117 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFBP38117 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFBP38117 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFBP38117 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFBP38117 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFBP38117 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFBP38117 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFBP38117 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFBP38117 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFBP38117 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFBP38117 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFBP38117 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFBP38117 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFBP38117 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFBP38117 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFBP38117 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFBP38117 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFBP38117 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFBP38117 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFBP38117 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFBP38117 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFBP38117 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFBP38117 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFBP38117 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFBP38117 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFBP38117 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFBP38117 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFBP38117 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFBP38117 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFBP38117 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFBP38117 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFBP38117 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFBP38117 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFBP38117 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETFBP38117 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFBP38117 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFBP38117 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFBP38117 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFBP38117 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFBP38117 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFBP38117 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFBP38117 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFBP38117 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFBP38117 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFBP38117 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFBP38117 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFBP38117 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFBP38117 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFBP38117 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFBP38117 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFBP38117 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFBP38117 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFBP38117 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFBP38117 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFBP38117 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFBP38117 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFBP38117 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFBP38117 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFBP38117 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFBP38117 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFBP38117 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFBP38117 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFBP38117 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFBP38117 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFBP38117 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFBP38117 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFBP38117 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFBP38117 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFBP38117 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFBP38117 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFBP38117 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFBP38117 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFBP38117 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFBP38117 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFBP38117 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFBP38117 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFBP38117 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFBP38117 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFBP38117 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFBP38117 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFBP38117 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFBP38117 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETFBP38117 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms