Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX11P35716 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX11P35716 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX11P35716 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX11P35716 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX11P35716 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX11P35716 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX11P35716 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX11P35716 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX11P35716 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX11P35716 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX11P35716 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX11P35716 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX11P35716 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX11P35716 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX11P35716 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX11P35716 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX11P35716 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX11P35716 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX11P35716 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX11P35716 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX11P35716 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX11P35716 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX11P35716 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX11P35716 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX11P35716 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX11P35716 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX11P35716 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX11P35716 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX11P35716 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX11P35716 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX11P35716 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX11P35716 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX11P35716 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX11P35716 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX11P35716 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX11P35716 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX11P35716 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX11P35716 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX11P35716 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX11P35716 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX11P35716 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX11P35716 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX11P35716 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX11P35716 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX11P35716 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX11P35716 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX11P35716 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX11P35716 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX11P35716 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX11P35716 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX11P35716 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX11P35716 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX11P35716 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX11P35716 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX11P35716 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX11P35716 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX11P35716 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX11P35716 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX11P35716 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX11P35716 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX11P35716 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX11P35716 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX11P35716 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX11P35716 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX11P35716 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX11P35716 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX11P35716 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX11P35716 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX11P35716 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX11P35716 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX11P35716 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX11P35716 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX11P35716 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX11P35716 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX11P35716 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX11P35716 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX11P35716 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX11P35716 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX11P35716 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX11P35716 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX11P35716 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX11P35716 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX11P35716 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX11P35716 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX11P35716 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX11P35716 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX11P35716 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX11P35716 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX11P35716 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX11P35716 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX11P35716 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX11P35716 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX11P35716 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX11P35716 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX11P35716 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX11P35716 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX11P35716 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX11P35716 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX11P35716 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms