Protein–RNA interactions for Protein: P35398

RORA, Nuclear receptor ROR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORAP35398 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORAP35398 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORAP35398 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORAP35398 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORAP35398 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORAP35398 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORAP35398 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORAP35398 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORAP35398 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORAP35398 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORAP35398 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORAP35398 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORAP35398 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORAP35398 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORAP35398 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORAP35398 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORAP35398 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORAP35398 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORAP35398 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORAP35398 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORAP35398 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORAP35398 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORAP35398 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORAP35398 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORAP35398 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORAP35398 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORAP35398 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RORAP35398 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORAP35398 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RORAP35398 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RORAP35398 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RORAP35398 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RORAP35398 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RORAP35398 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RORAP35398 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RORAP35398 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RORAP35398 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RORAP35398 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RORAP35398 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RORAP35398 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RORAP35398 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RORAP35398 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RORAP35398 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RORAP35398 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RORAP35398 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RORAP35398 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RORAP35398 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RORAP35398 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RORAP35398 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RORAP35398 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RORAP35398 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RORAP35398 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RORAP35398 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RORAP35398 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RORAP35398 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RORAP35398 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RORAP35398 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RORAP35398 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RORAP35398 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RORAP35398 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RORAP35398 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RORAP35398 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RORAP35398 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RORAP35398 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RORAP35398 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RORAP35398 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORAP35398 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORAP35398 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORAP35398 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORAP35398 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORAP35398 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORAP35398 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORAP35398 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORAP35398 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORAP35398 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORAP35398 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORAP35398 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORAP35398 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORAP35398 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORAP35398 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORAP35398 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORAP35398 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORAP35398 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORAP35398 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORAP35398 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORAP35398 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORAP35398 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORAP35398 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORAP35398 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORAP35398 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORAP35398 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RORAP35398 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RORAP35398 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORAP35398 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORAP35398 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORAP35398 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORAP35398 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORAP35398 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORAP35398 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RORAP35398 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms