Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXA13P31271 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms