Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA6P31267 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms