Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms