Protein–RNA interactions for Protein: P26640

VARS, Valine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARSP26640 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VARSP26640 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VARSP26640 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VARSP26640 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VARSP26640 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VARSP26640 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VARSP26640 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VARSP26640 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VARSP26640 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VARSP26640 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VARSP26640 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VARSP26640 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VARSP26640 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VARSP26640 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VARSP26640 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VARSP26640 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VARSP26640 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VARSP26640 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VARSP26640 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VARSP26640 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VARSP26640 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VARSP26640 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VARSP26640 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VARSP26640 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VARSP26640 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VARSP26640 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VARSP26640 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VARSP26640 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VARSP26640 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VARSP26640 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VARSP26640 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VARSP26640 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VARSP26640 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VARSP26640 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VARSP26640 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VARSP26640 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VARSP26640 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VARSP26640 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VARSP26640 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VARSP26640 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VARSP26640 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VARSP26640 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VARSP26640 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VARSP26640 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VARSP26640 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VARSP26640 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VARSP26640 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VARSP26640 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VARSP26640 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VARSP26640 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VARSP26640 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VARSP26640 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VARSP26640 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VARSP26640 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VARSP26640 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VARSP26640 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VARSP26640 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VARSP26640 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VARSP26640 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VARSP26640 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VARSP26640 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VARSP26640 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VARSP26640 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VARSP26640 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VARSP26640 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VARSP26640 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VARSP26640 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VARSP26640 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VARSP26640 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VARSP26640 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VARSP26640 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VARSP26640 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VARSP26640 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VARSP26640 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VARSP26640 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VARSP26640 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VARSP26640 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VARSP26640 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VARSP26640 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VARSP26640 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VARSP26640 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VARSP26640 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VARSP26640 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VARSP26640 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VARSP26640 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VARSP26640 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VARSP26640 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VARSP26640 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VARSP26640 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VARSP26640 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VARSP26640 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VARSP26640 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VARSP26640 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VARSP26640 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VARSP26640 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VARSP26640 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VARSP26640 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VARSP26640 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VARSP26640 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VARSP26640 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms