Protein–RNA interactions for Protein: P25705

ATP5A1, ATP synthase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5A1P25705 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms