Protein–RNA interactions for Protein: P24347

MMP11, Stromelysin-3, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP11P24347 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP11P24347 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP11P24347 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP11P24347 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP11P24347 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP11P24347 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP11P24347 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP11P24347 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP11P24347 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP11P24347 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP11P24347 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP11P24347 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP11P24347 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP11P24347 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP11P24347 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP11P24347 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP11P24347 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP11P24347 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP11P24347 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP11P24347 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP11P24347 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP11P24347 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP11P24347 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP11P24347 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP11P24347 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP11P24347 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP11P24347 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP11P24347 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP11P24347 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP11P24347 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP11P24347 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP11P24347 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP11P24347 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP11P24347 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP11P24347 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP11P24347 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP11P24347 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP11P24347 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP11P24347 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP11P24347 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP11P24347 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP11P24347 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP11P24347 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP11P24347 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP11P24347 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP11P24347 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP11P24347 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP11P24347 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP11P24347 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP11P24347 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP11P24347 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP11P24347 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP11P24347 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP11P24347 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP11P24347 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP11P24347 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP11P24347 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP11P24347 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP11P24347 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP11P24347 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP11P24347 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP11P24347 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP11P24347 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP11P24347 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP11P24347 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP11P24347 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP11P24347 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP11P24347 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP11P24347 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP11P24347 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP11P24347 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP11P24347 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP11P24347 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP11P24347 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP11P24347 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP11P24347 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP11P24347 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP11P24347 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP11P24347 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP11P24347 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP11P24347 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP11P24347 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP11P24347 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP11P24347 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP11P24347 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP11P24347 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP11P24347 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP11P24347 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP11P24347 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP11P24347 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP11P24347 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP11P24347 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP11P24347 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP11P24347 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP11P24347 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP11P24347 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP11P24347 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP11P24347 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP11P24347 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP11P24347 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms