Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms