Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
EPHA1P21709 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
EPHA1P21709 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
EPHA1P21709 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
EPHA1P21709 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
EPHA1P21709 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
EPHA1P21709 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
EPHA1P21709 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPHA1P21709 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPHA1P21709 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPHA1P21709 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPHA1P21709 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPHA1P21709 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPHA1P21709 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPHA1P21709 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPHA1P21709 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPHA1P21709 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
EPHA1P21709 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPHA1P21709 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPHA1P21709 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPHA1P21709 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPHA1P21709 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPHA1P21709 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPHA1P21709 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPHA1P21709 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPHA1P21709 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPHA1P21709 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPHA1P21709 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPHA1P21709 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPHA1P21709 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPHA1P21709 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPHA1P21709 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPHA1P21709 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPHA1P21709 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPHA1P21709 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms