Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms