Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HPGDP15428 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HPGDP15428 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HPGDP15428 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HPGDP15428 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HPGDP15428 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HPGDP15428 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HPGDP15428 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HPGDP15428 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HPGDP15428 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HPGDP15428 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HPGDP15428 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDP15428 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDP15428 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDP15428 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDP15428 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDP15428 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDP15428 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDP15428 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDP15428 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDP15428 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDP15428 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDP15428 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDP15428 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDP15428 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDP15428 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDP15428 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDP15428 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDP15428 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDP15428 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDP15428 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDP15428 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDP15428 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDP15428 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDP15428 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDP15428 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDP15428 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDP15428 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDP15428 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDP15428 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDP15428 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDP15428 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDP15428 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDP15428 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDP15428 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDP15428 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDP15428 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDP15428 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDP15428 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDP15428 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDP15428 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDP15428 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDP15428 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDP15428 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDP15428 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDP15428 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDP15428 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDP15428 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDP15428 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDP15428 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDP15428 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDP15428 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDP15428 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDP15428 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDP15428 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDP15428 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDP15428 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDP15428 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HPGDP15428 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HPGDP15428 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HPGDP15428 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HPGDP15428 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HPGDP15428 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HPGDP15428 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HPGDP15428 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HPGDP15428 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HPGDP15428 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HPGDP15428 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HPGDP15428 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HPGDP15428 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HPGDP15428 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HPGDP15428 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HPGDP15428 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HPGDP15428 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HPGDP15428 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HPGDP15428 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HPGDP15428 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HPGDP15428 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
HPGDP15428 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HPGDP15428 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HPGDP15428 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HPGDP15428 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HPGDP15428 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HPGDP15428 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HPGDP15428 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HPGDP15428 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HPGDP15428 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HPGDP15428 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HPGDP15428 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HPGDP15428 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms