Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TPRP12270 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TPRP12270 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TPRP12270 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TPRP12270 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TPRP12270 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TPRP12270 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TPRP12270 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TPRP12270 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TPRP12270 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TPRP12270 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TPRP12270 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TPRP12270 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TPRP12270 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TPRP12270 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TPRP12270 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TPRP12270 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TPRP12270 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TPRP12270 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TPRP12270 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TPRP12270 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TPRP12270 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TPRP12270 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TPRP12270 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TPRP12270 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TPRP12270 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TPRP12270 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TPRP12270 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TPRP12270 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TPRP12270 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TPRP12270 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TPRP12270 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPRP12270 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TPRP12270 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPRP12270 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TPRP12270 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TPRP12270 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TPRP12270 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TPRP12270 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPRP12270 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPRP12270 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TPRP12270 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TPRP12270 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TPRP12270 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TPRP12270 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPRP12270 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPRP12270 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPRP12270 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPRP12270 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TPRP12270 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TPRP12270 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TPRP12270 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPRP12270 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TPRP12270 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPRP12270 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TPRP12270 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPRP12270 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TPRP12270 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TPRP12270 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TPRP12270 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPRP12270 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TPRP12270 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TPRP12270 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TPRP12270 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TPRP12270 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TPRP12270 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPRP12270 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPRP12270 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TPRP12270 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPRP12270 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPRP12270 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TPRP12270 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TPRP12270 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TPRP12270 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TPRP12270 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TPRP12270 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TPRP12270 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TPRP12270 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TPRP12270 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TPRP12270 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TPRP12270 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TPRP12270 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TPRP12270 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TPRP12270 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
TPRP12270 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TPRP12270 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TPRP12270 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ 0
TPRP12270 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TPRP12270 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TPRP12270 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TPRP12270 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC15.05■□□□□ 0
TPRP12270 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ 0
TPRP12270 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.05■□□□□ 0
TPRP12270 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TPRP12270 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TPRP12270 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TPRP12270 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TPRP12270 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TPRP12270 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TPRP12270 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms