Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms