Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms